这部电影的故事在某种程度上是基于今年3月上映的最新游戏《樱花大战3》的情节。虽然游戏的主角奥加米中尉讲述了故事的一个方面，但电影揭示了花谷米背后的秘密。奥伽米离开巴黎，结果留下了没有领导人的花谷美，因此一个新的字符将介绍在这里。将由大谷中尉接替的是前小泉的领导人拉切特·阿蒂尔，一个理性主义者和独特的个人，他给花谷带来了严重的问题。成员们现在和瑞切尔意见不合。与此同时，Teikoku Kagekid...

小新在河边无意间捡到一颗弹珠，看它很闪亮于是就捡回家里。没想到却被小葵吞进肚子里。这下糟了，原来这颗弹珠是珠由良族与珠黄泉族在争夺的魔人贾克的珠珠，珠黄泉族的首领玉王想要利用贾克的魔力征服世界。就这样，小新一家人卷入两族人的争夺战中，小葵被玉王绑架走了，大家为了保护小葵，费尽心力…最后平安的救出小葵，小新却在无意间，将两颗珠珠放进封印贾克的人俑里，魔人贾克被释放出来了.........

这日柯南、小兰一行人来到米花市市政大厅，一场有关最新游戏“茧”的发布会正在这里召开。由于迥异于以往任何一款游戏的“茧”可能一举改变全球游戏业界的价值观，发布会吸引了代表日本上流社会的政治、财经、演艺界人士，50名游戏体验者也多是他们的后代，新一的父亲、推理小说大师工藤优作由于参与故事编写，也来到现场。这边热热闹闹，游戏的研发者兼负责人坚村却被杀于地下室。坚村死前留在键盘J、T、R上的血迹令柯南想到...