只有被選上的人才能操縱的「案山子」，據說是神的分身而受人祭祀。就在此時，東京這個大都市竟然陸續出現離奇死亡案件!!究竟是人類所為？還是…...

吾郎想在圣秀建立一个棒球社打败海堂，但是圣秀高中从几年才从女校改成男女合校，所以学校男生人数根本不到十个，在吾郎好说歹说下，大家终於愿意加入棒球社，在吾郎的爸爸茂野的训练下，打算在3年级时参加比赛，但在一次因缘际会下，球队监督连络到了海堂的2军，於是他们之间开始了一场练习赛，江头在比赛中故意指使一个球员踩伤吾郎的脚，害的吾郎在县内比赛开始时以负伤的情况参加，一路努力终於打到了县内决赛，圣秀V.S海...

『鋼鉄ジーグ』から50年後の2025年。九州全域は50年前に発生した謎のゾーンに覆われたままになっていた。その九州に近い下関にハニワ幻神（げんじん）が再び出現。草薙剣児は鋼鉄神ジーグのパイロットとなり、幼馴染の珠城つばきや親友の美角鏡らと共に新ビルドベースの下、妃魅禍率いる邪魔大王国に戦いを挑む。...